1965 – Początki w Sekcji Żeglarskiej WKS Legia
Nestorzy i założyciele Klubu wywodzą się z Sekcji Żeglarskiej WKS Legia. Pierwszy rejs morski odbył się w roku 1965 na nowo zakupionym, drewnianym, dwumasztowym jachcie s/y OPAL. Był to pierwszy z serii jachtów znanej klasy Opal. W 1968 SŻ Legii wzbogaciła się o drugi jacht s/y LEGIA, który w swoim pierwszym rejsie z Gdyni do Amsterdamu odwiedził porty Danii, Szwecji, Holandii, a w drodze powrotnej porty NRF i NRD. W 1969 roku z przyczyn finansowych nastąpiła reorganizacja WKS Legia, a jednym ze skutków było rozwiązanie Sekcji Żeglarskiej Legii. Żeglarze morscy rozwiązanej sekcji postanowili założyć klub morski skupiający kadrę Garnizonu Warszawskiego, który stałby się armatorem jachtów OPAL i LEGIA.
1971 – Powstanie Jacht Klubu ATOL
20 października 1970 roku odbyło się zebranie aktywu żeglarskiego w celu powołania tymczasowego zarządu klubu. Głównym zadaniem wybranego zarządu było ustalenie założeń organizacyjnych oraz podjęcie prac przygotowawczych w celu rejestracji klubu i przejęcia w użytkowanie jachtów.
W skład zarządu weszli:
- Komandor Eugeniusz Androsiuk
- Wicekom. ds. org. Tadeusz Monczulewicz
- Wicekom. ds. szkol. Ryszard Kukliński
- Wicekom. ds. techn. Mieczysław Jarczyński
- Sekretarz Stanisław Radaj
- Skarbnik Henryk Wasilewicz
- Członkowie zarządu: Jerzy Czeszko, Tadeusz Krawczyk, Hieronim Kubera
Oficjalnie Jacht Klub ATOL został powołany do życia 28 kwietnia 1971 r. uzyskując wpis do rejestru Urzędu Spraw Wewnętrznych Prezydium Rady Narodowej m. st. Warszawy pod numerem 947. Klub był armatorem jachtów OPAL i LEGIA, a ich portem macierzystym była Gdynia. 20.10.1972 r. decyzją Rady WF, Sportu i Turystyki MON jachty OPAL i LEGIA z WKS Legia zostały przekazane w użytkowanie JKM ATOL, a ich miejscem bazowania, na podstawie umowy z Marynarką Wojenną, była keja Ośrodka Szkolenia Żeglarskiego MW w Gdyni.
1980 – Nowy etap: s/y Farurej
W 1980 s/y OPAL na skutek złego stanu technicznego nie uzyskał dopuszczenia do żeglugi i został spisany ze stanu. Na jego miejsce klub otrzymał w użytkowanie nowo zbudowany jacht klasy Opal IV, któremu nadano imię FARUREJ. Farurej odbył swój inauguracyjny rejs w czerwcu 1980 r. do Leningradu (Sankt Petersburga), a jego kapitanem był ówczesny komandor klubu Ryszard Kukliński. Więcej o obecnym s/y Farurej przeczytasz na stronie jachtu.
1982 – Integracja z JKMW Kotwica
W wyniku reorganizacji struktur wojskowych w 1982 roku, JKM ATOL stał się warszawskim oddziałem Jacht Klubu Marynarki Wojennej „Kotwica”. Siedziba klubu kilka razy się przenosiła: z ul. Wiśniowej, przez Wita Stwosza i Krajewskiego, na ul. 11 Listopada 17/19, gdzie jesteśmy od 2002 roku.
2019 – Osobowość prawna
Przełomem był rok 2019, w którym Oddział ATOL uzyskał osobowość prawną jako terenowa jednostka organizacyjna. Pozwoliło to na pełną autonomię działania przy zachowaniu więzi z centralnym klubem w Gdyni.



